À l'École des Arts Appliqués où elle étudie le dessin de mode de 1967 à 1971, Annie Goetzinger suit les cours de Georges Pichard. Remarquant ses dessins, Jacques Lob la fait entrer à Pilote. Elle publie également dans la revue Lisette. Elle réalise son premier album en 1975, Casque d'or, grâce auquel elle reçoit deux prix au Festival d'Angoulême.
En 1978, elle illustre une biographie de George Sand, Aurore. Aurore Dupin devient George Sand, sur un texte de Adela Turin. L'ouvrage obtient l'année suivante le Premio Grafico Fiera di Bologna per la Gioventù, de la Foire du livre de jeunesse de Bologne2 (Italie).
Elle crée le personnage qui la fera connaître, Félina. Elle publie également des planches dans Circus, L'Écho des savanes, Fluide glacial… Elle est l'une des rares dessinatrices de l'époque, avec Claire Bretécher ou Chantal Montellier. Elle a surtout travaillé avec Pierre Christin dès 1980.