Carlos Trillo commence sa carrière de scénariste prolixe à l'âge de 20 ans en écrivant un scénario pour le magazine Patoruzu. En 1973, il prend la direction du magazine irrévérencieux Satiricon. L'année suivante il rencontre Alberto Breccia avec qui il entame Un certain Daneri, puis Horacio Altuna avec qui il crée Chavez le fou. Mais la dictature militaire de 1976 interrompt la parution de la revue et Trillo est obligé de revenir à un discours plus conventionnel.
Il élargit alors son activité et commence à écrire pour diverses revues (El Pendulo, Humor, Superhumor…), tout en continuant à collaborer avec Altuna sur de nombreux titres dont Charlie Moon, Merdichevski, Les Petites Portes de M. Lopez et Slot Machine. Il débute au même moment une collaboration avec Domingo Mandrafina à travers Histoires sans paroles, puis El Husmeante. Dans les années 80 il continuera à développer son style et à travailler et ferait naitre de nombreuses série avec la crème des dessinateurs argentins : Peter Kampf et Cosecha Verde toujours avec Madrafina, Carnage Plus et Light and Bold avec Jordi Bernet), Fulù, Simon et JC Benedict avec Eduardo Risso ou encore Gangrène avec Juan Gimenez.
C'est en 1992 qu'il crée sa série la plus connue, Cybersix, récit d'anticipation présentant des créatures manipulés génétiquement brillamment illustré par Carlos Meglia.